Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF1Q13905 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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