Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR3Q13615 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR3Q13615 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR3Q13615 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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