Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAE1Q13564 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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