Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FMODQ06828 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FMODQ06828 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FMODQ06828 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FMODQ06828 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FMODQ06828 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FMODQ06828 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FMODQ06828 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FMODQ06828 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FMODQ06828 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FMODQ06828 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FMODQ06828 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FMODQ06828 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FMODQ06828 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FMODQ06828 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FMODQ06828 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms