Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELAQ04206 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELAQ04206 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELAQ04206 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELAQ04206 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELAQ04206 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELAQ04206 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELAQ04206 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELAQ04206 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELAQ04206 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELAQ04206 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELAQ04206 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELAQ04206 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELAQ04206 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELAQ04206 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELAQ04206 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms