Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDR2Q01850 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDR2Q01850 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDR2Q01850 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms