Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTRA4P83105 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTRA4P83105 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms