Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL7AP62424 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL7AP62424 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL7AP62424 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms