Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPFP62306 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms