Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3EP60228 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3EP60228 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3EP60228 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms