Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF3P57682 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF3P57682 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF3P57682 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF3P57682 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF3P57682 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF3P57682 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF3P57682 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF3P57682 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF3P57682 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF3P57682 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF3P57682 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF3P57682 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF3P57682 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms