Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL23P55773 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL23P55773 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL23P55773 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL23P55773 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL23P55773 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL23P55773 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL23P55773 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL23P55773 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL23P55773 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL23P55773 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL23P55773 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL23P55773 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL23P55773 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL23P55773 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL23P55773 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL23P55773 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL23P55773 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL23P55773 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL23P55773 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL23P55773 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL23P55773 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL23P55773 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCL23P55773 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL23P55773 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL23P55773 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL23P55773 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms