Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC12A3P55017 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC12A3P55017 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC12A3P55017 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms