Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP98P52948 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP98P52948 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP98P52948 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP98P52948 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP98P52948 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP98P52948 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP98P52948 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP98P52948 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP98P52948 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP98P52948 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP98P52948 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP98P52948 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP98P52948 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP98P52948 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP98P52948 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP98P52948 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP98P52948 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP98P52948 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP98P52948 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUP98P52948 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUP98P52948 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NUP98P52948 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP98P52948 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP98P52948 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP98P52948 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP98P52948 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP98P52948 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP98P52948 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP98P52948 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP98P52948 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP98P52948 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP98P52948 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP98P52948 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP98P52948 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP98P52948 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP98P52948 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms