Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLCN6P51797 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN6P51797 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms