Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERFP50548 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERFP50548 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERFP50548 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERFP50548 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERFP50548 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERFP50548 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERFP50548 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERFP50548 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERFP50548 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERFP50548 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERFP50548 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERFP50548 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERFP50548 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERFP50548 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERFP50548 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERFP50548 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms