Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRIP1P48552 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms