Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF5P43026 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF5P43026 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF5P43026 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF5P43026 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF5P43026 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF5P43026 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF5P43026 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF5P43026 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF5P43026 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF5P43026 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF5P43026 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF5P43026 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF5P43026 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF5P43026 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF5P43026 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF5P43026 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF5P43026 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF5P43026 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF5P43026 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF5P43026 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms