Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR1BP42025 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTR1BP42025 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR1BP42025 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1BP42025 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1BP42025 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1BP42025 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms