Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTF3P20783 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTF3P20783 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTF3P20783 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTF3P20783 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTF3P20783 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTF3P20783 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTF3P20783 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTF3P20783 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTF3P20783 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTF3P20783 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NTF3P20783 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NTF3P20783 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTF3P20783 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms