Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBP3P10745 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBP3P10745 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBP3P10745 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBP3P10745 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBP3P10745 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP3P10745 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP3P10745 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBP3P10745 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP3P10745 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP3P10745 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP3P10745 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP3P10745 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBP3P10745 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBP3P10745 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP3P10745 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP3P10745 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms