Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49P0CI25 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms