Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSF1RP07333 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSF1RP07333 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms