Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND1P03886 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MT-ND1P03886 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND1P03886 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms