Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYPD3O95274 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYPD3O95274 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LYPD3O95274 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD3O95274 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD3O95274 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD3O95274 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD3O95274 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD3O95274 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD3O95274 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD3O95274 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD3O95274 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms