Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24DO94855 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms