Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RPS6KA4O75676 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KA4O75676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KA4O75676 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KA4O75676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms