Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRCPO75575 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRCPO75575 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRCPO75575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRCPO75575 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRCPO75575 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRCPO75575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRCPO75575 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRCPO75575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRCPO75575 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRCPO75575 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRCPO75575 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRCPO75575 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRCPO75575 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms