Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP3O75154 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP3O75154 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB11FIP3O75154 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB11FIP3O75154 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms