Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DFNA5O60443 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DFNA5O60443 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DFNA5O60443 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms