Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHDO14521 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHDO14521 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHDO14521 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHDO14521 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHDO14521 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHDO14521 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHDO14521 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHDO14521 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHDO14521 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHDO14521 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHDO14521 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDHDO14521 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHDO14521 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHDO14521 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHDO14521 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHDO14521 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms