Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK1AO00322 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK1AO00322 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms