Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB2A8KAH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HSPB2A8KAH6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB2A8KAH6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms