Protein–RNA interactions for Protein: A6NLW8

DUXA, Double homeobox protein A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAA6NLW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUXAA6NLW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUXAA6NLW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUXAA6NLW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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