Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPB15A6NHN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB15A6NHN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms