Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC13A5PLN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms