Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPED1A4D0V7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPED1A4D0V7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPED1A4D0V7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms