Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMD3A2A2Y4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms