Protein–RNA interactions for Protein: A1L170

C1orf226, Uncharacterized protein C1orf226, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf226A1L170 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf226A1L170 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf226A1L170 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms