Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LP49

CCDC187, Coiled-coil domain-containing protein 187, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC187A0A096LP49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC187A0A096LP49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC187A0A096LP49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC187A0A096LP49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms