Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARFGEF2Q9Y6D5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARFGEF2Q9Y6D5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARFGEF2Q9Y6D5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARFGEF2Q9Y6D5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARFGEF2Q9Y6D5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARFGEF2Q9Y6D5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARFGEF2Q9Y6D5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
ARFGEF2Q9Y6D5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARFGEF2Q9Y6D5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARFGEF2Q9Y6D5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARFGEF2Q9Y6D5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ARFGEF2Q9Y6D5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARFGEF2Q9Y6D5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARFGEF2Q9Y6D5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARFGEF2Q9Y6D5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms