Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G6

PCDHGA7, Protocadherin gamma-A7, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHGA7Q9Y5G6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHGA7Q9Y5G6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHGA7Q9Y5G6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHGA7Q9Y5G6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHGA7Q9Y5G6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHGA7Q9Y5G6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGA7Q9Y5G6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHGA7Q9Y5G6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDHGA7Q9Y5G6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHGA7Q9Y5G6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHGA7Q9Y5G6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA7Q9Y5G6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGA7Q9Y5G6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGA7Q9Y5G6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHGA7Q9Y5G6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGA7Q9Y5G6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHGA7Q9Y5G6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA7Q9Y5G6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA7Q9Y5G6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA7Q9Y5G6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHGA7Q9Y5G6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHGA7Q9Y5G6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHGA7Q9Y5G6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHGA7Q9Y5G6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHGA7Q9Y5G6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHGA7Q9Y5G6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGA7Q9Y5G6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGA7Q9Y5G6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGA7Q9Y5G6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGA7Q9Y5G6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGA7Q9Y5G6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms