Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF12Q9Y4X4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF12Q9Y4X4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF12Q9Y4X4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF12Q9Y4X4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF12Q9Y4X4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF12Q9Y4X4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF12Q9Y4X4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF12Q9Y4X4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF12Q9Y4X4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF12Q9Y4X4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF12Q9Y4X4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF12Q9Y4X4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF12Q9Y4X4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF12Q9Y4X4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF12Q9Y4X4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF12Q9Y4X4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF12Q9Y4X4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF12Q9Y4X4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF12Q9Y4X4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF12Q9Y4X4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF12Q9Y4X4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF12Q9Y4X4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF12Q9Y4X4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF12Q9Y4X4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF12Q9Y4X4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF12Q9Y4X4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF12Q9Y4X4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF12Q9Y4X4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF12Q9Y4X4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF12Q9Y4X4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms