Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
R3HCC1Q9Y3T6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
R3HCC1Q9Y3T6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HCC1Q9Y3T6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HCC1Q9Y3T6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
R3HCC1Q9Y3T6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
R3HCC1Q9Y3T6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
R3HCC1Q9Y3T6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
R3HCC1Q9Y3T6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
R3HCC1Q9Y3T6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
R3HCC1Q9Y3T6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
R3HCC1Q9Y3T6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HCC1Q9Y3T6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
R3HCC1Q9Y3T6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
R3HCC1Q9Y3T6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
R3HCC1Q9Y3T6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
R3HCC1Q9Y3T6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HCC1Q9Y3T6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
R3HCC1Q9Y3T6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
R3HCC1Q9Y3T6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
R3HCC1Q9Y3T6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
R3HCC1Q9Y3T6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HCC1Q9Y3T6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HCC1Q9Y3T6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
R3HCC1Q9Y3T6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HCC1Q9Y3T6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
R3HCC1Q9Y3T6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
R3HCC1Q9Y3T6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
R3HCC1Q9Y3T6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
R3HCC1Q9Y3T6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
R3HCC1Q9Y3T6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
R3HCC1Q9Y3T6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
R3HCC1Q9Y3T6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
R3HCC1Q9Y3T6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
R3HCC1Q9Y3T6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
R3HCC1Q9Y3T6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
R3HCC1Q9Y3T6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
R3HCC1Q9Y3T6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
R3HCC1Q9Y3T6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
R3HCC1Q9Y3T6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
R3HCC1Q9Y3T6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
R3HCC1Q9Y3T6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
R3HCC1Q9Y3T6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
R3HCC1Q9Y3T6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
R3HCC1Q9Y3T6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
R3HCC1Q9Y3T6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
R3HCC1Q9Y3T6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms