Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 58.13□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 49
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 521.16■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 FOXK2-205ENST00000529652 2199 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 FOXK2-209ENST00000571989 573 ntTSL 516.75■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 48.5
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DDX52Q9Y2R4 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 513.9□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 39.96□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 59.79□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 48.5
DDX52Q9Y2R4 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 216.99■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 48.3
DDX52Q9Y2R4 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 48.1
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 516.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 47.8
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 47.8
DDX52Q9Y2R4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 221.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 316.26■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 212.71□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 310.89□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 49.15□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 47.4
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 46.8
DDX52Q9Y2R4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 46.4
DDX52Q9Y2R4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 46.4
DDX52Q9Y2R4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 46.4
DDX52Q9Y2R4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 46.4
DDX52Q9Y2R4 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 311.66□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 46.4
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DDX52Q9Y2R4 RAP1B-233ENST00000545720 552 ntTSL 528.21■■■□□ 2.117e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.887e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.877e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-213ENST00000501412 1488 ntTSL 226.36■■□□□ 1.817e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-217ENST00000538283 591 ntTSL 426.25■■□□□ 1.797e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.627e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-209ENST00000460800 755 ntTSL 324.57■■□□□ 1.527e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-214ENST00000534899 606 ntTSL 424.57■■□□□ 1.527e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.527e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.57e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-219ENST00000538980 587 ntTSL 323.82■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 45.5
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DDX52Q9Y2R4 RAP1B-223ENST00000541167 561 ntTSL 423.82■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-222ENST00000540781 571 ntTSL 423.65■■□□□ 1.387e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-206ENST00000425247 855 ntTSL 523.65■■□□□ 1.387e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-205ENST00000422358 468 ntTSL 423.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-208ENST00000453560 530 ntTSL 423.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 522.95■■□□□ 1.267e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-227ENST00000542018 633 ntTSL 422.4■■□□□ 1.187e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.057e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 421.51■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 421.51■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.987e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-232ENST00000545270 640 ntTSL 321.19■□□□□ 0.987e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-225ENST00000541386 480 ntTSL 421.19■□□□□ 0.987e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.837e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-210ENST00000463493 781 ntTSL 419.23■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-211ENST00000485252 312 ntTSL 518.92■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 516.89■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 216.67■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-220ENST00000600710 565 ntTSL 516.48■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 415.55■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.027e-8■■■■■ 45.5
DDX52Q9Y2R4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 45.5
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