Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HHLA3Q9XRX5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HHLA3Q9XRX5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHLA3Q9XRX5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHLA3Q9XRX5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HHLA3Q9XRX5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HHLA3Q9XRX5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HHLA3Q9XRX5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HHLA3Q9XRX5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA3Q9XRX5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHLA3Q9XRX5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA3Q9XRX5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HHLA3Q9XRX5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HHLA3Q9XRX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HHLA3Q9XRX5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HHLA3Q9XRX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA3Q9XRX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms