Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM2Q9UQ35 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRM2Q9UQ35 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRM2Q9UQ35 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRM2Q9UQ35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRM2Q9UQ35 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM2Q9UQ35 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM2Q9UQ35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM2Q9UQ35 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM2Q9UQ35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM2Q9UQ35 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM2Q9UQ35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM2Q9UQ35 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM2Q9UQ35 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM2Q9UQ35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM2Q9UQ35 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM2Q9UQ35 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRM2Q9UQ35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRM2Q9UQ35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRRM2Q9UQ35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM2Q9UQ35 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRM2Q9UQ35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRM2Q9UQ35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRRM2Q9UQ35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms