Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
L1RE1Q9UN81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
L1RE1Q9UN81 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
L1RE1Q9UN81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
L1RE1Q9UN81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
L1RE1Q9UN81 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
L1RE1Q9UN81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
L1RE1Q9UN81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
L1RE1Q9UN81 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
L1RE1Q9UN81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
L1RE1Q9UN81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
L1RE1Q9UN81 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
L1RE1Q9UN81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
L1RE1Q9UN81 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1RE1Q9UN81 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
L1RE1Q9UN81 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
L1RE1Q9UN81 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
L1RE1Q9UN81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
L1RE1Q9UN81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
L1RE1Q9UN81 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
L1RE1Q9UN81 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
L1RE1Q9UN81 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
L1RE1Q9UN81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
L1RE1Q9UN81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
L1RE1Q9UN81 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
L1RE1Q9UN81 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
L1RE1Q9UN81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
L1RE1Q9UN81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
L1RE1Q9UN81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
L1RE1Q9UN81 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
L1RE1Q9UN81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
L1RE1Q9UN81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
L1RE1Q9UN81 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
L1RE1Q9UN81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
L1RE1Q9UN81 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
L1RE1Q9UN81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
L1RE1Q9UN81 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
L1RE1Q9UN81 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms