Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB10Q9UN67 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB10Q9UN67 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB10Q9UN67 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB10Q9UN67 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB10Q9UN67 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB10Q9UN67 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB10Q9UN67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB10Q9UN67 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB10Q9UN67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB10Q9UN67 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB10Q9UN67 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB10Q9UN67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB10Q9UN67 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB10Q9UN67 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB10Q9UN67 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB10Q9UN67 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB10Q9UN67 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB10Q9UN67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB10Q9UN67 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB10Q9UN67 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB10Q9UN67 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB10Q9UN67 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB10Q9UN67 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB10Q9UN67 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB10Q9UN67 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB10Q9UN67 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB10Q9UN67 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB10Q9UN67 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB10Q9UN67 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms