Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCOLCE2Q9UKZ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCOLCE2Q9UKZ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCOLCE2Q9UKZ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCOLCE2Q9UKZ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCOLCE2Q9UKZ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCOLCE2Q9UKZ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCOLCE2Q9UKZ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCOLCE2Q9UKZ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCOLCE2Q9UKZ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCOLCE2Q9UKZ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCOLCE2Q9UKZ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCOLCE2Q9UKZ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCOLCE2Q9UKZ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCOLCE2Q9UKZ9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCOLCE2Q9UKZ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCOLCE2Q9UKZ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCOLCE2Q9UKZ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCOLCE2Q9UKZ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCOLCE2Q9UKZ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCOLCE2Q9UKZ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCOLCE2Q9UKZ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms